Per aconseguir les finalitats que té assignades, el Consorci d’Aigües Costa Brava Girona s'estructura actualment en vuit serveis:
- Tres que configuren els serveis tècnics per a la prestació i compliment de les finalitats de l’organisme:
- Abastament i Regeneració
- Sanejament
- Projectes i Obres
- Cinc serveis més que, a part de gestionar el funcionament intern de l'organisme, donen suport als tres primers per assegurar la consecució eficaç dels seus propòsits:
- Secretaria, Administració General i Organització
- Contractació i Compra pública
- Serveis Econòmics
- Servei Jurídic
- Patrimoni i Expropiacions
La Relació de llocs de treball del Consorci d’Aigües Costa Brava Girona conforma l’actual estructura orgànica la qual queda configurada de la següent manera en dos nivells, un de coordinació i l’altra de gestió:
